科研的着力点可以是某类分子,或者某个生物学过程,抑或某种科研工具,然后组合串联,解决某种科学问题,给出重要的分子机制,红花配绿叶的模式,看看都有哪些。
circRNAs(Circular RNAs,环形RNA分子)是一类不具有5' 末端帽子和3' 末端poly(A)尾巴,并以共价键形成环形结构的非编码RNA分子。circRNA是由非经典剪接方式进行反向剪接而形成。
长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RNA。研究表明, lncRNA 在剂量补偿效应(Dosage compensationeffect)、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用,成为遗传学研究热点。
外泌体是一种存在于细胞外的多囊泡体,直径为40-110 nm,其内部包含RNA、蛋白质、microRNA、DNA片段等多种成分,在血液、唾液、尿液、脑脊液和母乳等多种体液中均有分布。
细胞自噬(autophagy)一词来自希腊单词auto-,意思是“自己的”,以及phagein,意思是“吃”。所以,细胞自噬的意思就是“吃掉自己”。
热点一:circRNA
大部分的circRNA在不同物种间是保守的,同时其环状结构能抵抗RNase R的降解而比较稳定,可以作为潜在的疾病诊断的标志物。circRNA由于其表达的特异性和调控的复杂性,近些年研究热度很高。
在转录组研究中,研究思路不外乎高通量测序,差异表达分析,选择感兴趣的circRNA进行功能研究。
热点二:lncRNA
LncRNA一直是研究的热点,其作用机制多元,并不像miRNA那样具有固定的模式,这也是研究的难点之一,目前高通量测序能检测到的数量为3万多个。
LncRNA目前所知至少有10种作用模式,分别在转录、转录后、翻译后水平参与调控机制。
热点三:外泌体(exosome)
外泌体是一种存在于细胞外的多囊泡体,直径为40-110 nm,其内部包含RNA、蛋白质、microRNA、DNA片段等多种成分,在血液、唾液、尿液、脑脊液和母乳等多种体液中均有分布,获2013年的诺贝尔医学奖。
外泌体参与的生物学过程包括:①介导肿瘤细胞的增生和干性形成②介导肿瘤微环境中血管的形成③介导肿瘤细胞的免疫耐受④介导肿瘤细胞的化疗抵抗⑤组分中的miRNA参与众多疾病的调控。
热点四:自噬(Autophagy)
“自己吃自己”,这个很多童鞋都知道的,在获得2016年获诺贝尔医学奖的之前,已经火了很多年了,今年以及明年将应该科研小高峰。
热点五:基因编辑CRISPR
敲除都是很基础的用法了,如果想提升文章的深度和逼格,可以尝试一下基因敲入(Knockin),基因干扰(CRISPR/i)、基因激活(CRISPR/a)、CRISPR高通量筛选(Screen)等,其在临床疾病上的科研应用非常广泛。
热点六:生物信息、数据挖掘
严格来讲,这只是一种发现差异分子、兴趣基因的手段,不过其已经成为重要的科学研究热点。
肿瘤等疾病相关数据库,大家比较熟悉有NIH旗下的TCGA,NCBI旗下的GEO等,汇集了全世界范围内高通量测序、芯片检测的数据,其中蕴涵了大量生物信息数据,传统的实验模式很难规模化研究,而基于大数据的生物信息学,可以帮助我们找到有价值有研究意义的分子,除却了非得做实验的繁琐,而且还提高科研的效率的准确度,在科研分段进行的过程中,数据挖掘找到差异分子,验证成功后就可以很顺利地开展后续的功能实验、机制研究了。
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