circRNA是国自然基金申请的新的热点，那么，问题来了，如果在研究里面从circRNA入手，往下该怎么走，circRNA研究到底可以往哪些方向呢？我们在基金申请时，该怎么样设计研究思路呢？

总的来说，对于circRNA研究的大方向主要有两个：功能机制研究和biomarker研究。对于国自然申请，把这两部分都放在里面会使你的研究更加丰富，更加具有科研意义。下面就我们的研究方向提出两个问题~

为什么circRNA能用于biomarker研究？

由于circRNA 稳定表达、不易降解 、具有组织特异性、疾病特异性等特点，且血液中已经发现丰富的表达， 使得circRNA 成为理想的Biomarker。现有的很多发表文献都是从这个方向入手，而且也有研究把circRNA，外泌体同时放进来，使circRNA的biomarker研究更加有意义（Cell Research (2015) 25:981-984.）。而在设计circRNA作为疾病诊断的biomarker时，思路也是非常清晰：

（1）评估候选biomarker与临床指标相关性；

（2）biomarker模型诊断效价评估；

（3）独立样本有效性验证。

circRNA机制研究具体有哪些方向？

由于circRNA，相对来说是一个新的东西，所以研究难度是肯定有的。从目前的报道文献来说，circRNA的作用方式主要由以下三类：

（1）cis调控母基因表达

由于circRNA的来源比较特殊（很多情况下有线性RNA的反向剪接而来），所以，他们的存在与线性母基因之间有着千丝万缕的联系。有报道显示，circRNA可以通过cis模式调控母基因的表达（Nat Struct Mol Biol. 2015 Mar;22(3):256-64.）。

因此，当找到一些疾病特异性的circRNAs后，第一步应该看看对应的母基因表达是否有明显异常。

（2）ceRNA调控模式

ceRNA是一类通过竞争性结合microRNA来影响microRNA—RNA的转录后调控。现有研究表明，lncRNA，mRNA或者circRNA都可能是ceRNA分子。目前也有一些非常好的研究就是从这个方向入手，来阐述circRNA作为miRNA的“sponge”而发挥生物学功能（Nat Commun. 2016 Apr 6;7:11215.）。

（3）与蛋白结合发挥功能

现有的一些研究发现，circRNA可以和蛋白结合，发挥生物学功能。对于这样的研究方向，一个必不可少的前体是，首先去发现能和circRNA结合的蛋白，然后去验证这种关系对其生物学功能的重要性。对于这样的研究思路，目前也是有很好的文章值得参考（Nat Commun. 2016 Aug 19;7:12429.）。

那么，问题就来了，在申请基金时，写作用机制这部分到底该选哪个方向呢？其实问题很好办，只要通过一些生物信息学分析或者已有的一些预实验，去看看circRNA最有可能在本研究中的作用方式就可以了。

总的来说，circRNA的国自然申请有其特点，也有其广泛性。特点在于circRNA是一个目前还研究很少的新的东西，所以，从circRNA研究肯定是一个新的亮点；广泛性在于转录组研究，无论是线性的还是环状的，很多研究的思路，研究的实验方法都是相通的。所以，circRNA为基础的国自然申请，一定会给你的研究增添亮点。

circRNA最新综述分享

今天我们来介绍两篇2018年最新的circRNA研究的综述，如果大家做相关研究或者在写标书，要记得引用哦！

1. Circular RNA and its mechanisms in disease: From the bench to the clinic.Pharmacol. Ther. 2018 Feb 14

这篇文章是关于circRNA在各个疾病中研究进展的大综述，内容包括了circRNA的基本介绍、circRNA的特征、产生、功能，在疾病中的研究进展，用于治疗的优势以及未来展望：

下面我们挑部分内容来简单看一下：

这是文章的第一个figure，综述了circRNA的不同产生和作用方式（功能），从产生方式上，包括了（1）RBP相关的 （2）Intron pairing （3）Lariat 以及由tRNA产生的tricRNA；在作用方式上，既有大家熟悉的作为miRNA的sponge发挥功能的ceRNA机制，还有促进转录的两种方式（E）和（F），另外，结合蛋白以及蛋白（小肽）翻译我们也都介绍过：研究circRNA发10分以上的杂志，这三个思路你都知道吗？

文章的第二个figure是circRNA在疾病中的研究：

红色的字体是肿瘤，黑色的字体是其它疾病，可见在circRNA的研究主要还是集中在肿瘤中，基本占到了1/3到1/2的比例，在table1中综述了各个系统的研究，下面是除了肿瘤外在其它疾病或者系统中的研究：

figure 3是circRNA在不同疾病中的作用机制：

我们可以看到作为miRNA sponge的最多，其次是与RNA结合蛋白（RBP）互作的，相对较少的是翻译。

最后是table2，主要说的是circRNA作为肿瘤的biomarker，图比较大，我们就不放上来了。

2. The Potential Role of circRNA in Tumor Immunity Regulation and Immunotherapy.Front Immunol 2018 ;9(影响因子6.4)

这篇综述主要讲的是肿瘤免疫调节和免疫治疗中circRNA的作用机制，当然，尽管题目是circRNA，综述里面还有一些线性的非编码RNA的内容。 文章的第一张图综述的是免疫治疗的四个方向：

即：CART，免疫检查点，疫苗和溶瘤病毒。

figure 2说的是肿瘤免疫治疗中circRNA的作用：

包括了（A）miRNA sponge、(B)与蛋白结合，以及（C）通过外泌体转运到免疫细胞吸附miRNA发挥功能和（D）在外泌体中结合miRNA，进入免疫细胞后释放miRNA发挥功能；

Table1是线性ncRNA与抗肿瘤免疫的综述：

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