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警惕国自然热点中的坑
2018-08-31    来源:整理于网络

这段时间对于2018国自然基金数据的分析很多很多,大部分都是对于热点的分析。看这些分析的时候,先是很感谢分析数据的专家,一秒之后就后背发凉,担心大家掉进坑里去。今天就跟大家分享一下,有哪些坑。给您提个醒。

先看看数据(来源于网络),医学科学部共有9830项获得资助。然后看热点资助数据。

MirRNA,685项,占比7.0%。

LncRNA,372项,占比3.8%。

CircRNA,185项,占比1.9%。

外泌体,400项,占比4.1%。

自噬,460项,占比4.7%。

其他的热点不罗列了,大家可以到网上搜搜。这些热点中的坑,在哪里呢?

我们先看看国自然的评审要求。青年基金评审,因为是支持青年学者做研究,评审相对宽松,只要前期工作有SCI文章,申请项目创新性及课题设计没有大的问题,中标是有保障的。而面上呢,1、前期发表SCI情况。这里评价的是研究能力。大部分口子默认的是5分以上文章的发表情况。2、青年基金结题情况,或者前一个面上结题情况。评价的是对于获得资助项目的研究结题能力。

只列出这两条吧。国自然讲座中提出过一个问题,国自然申请中最重要的是什么?其实不是中标,而是中标后能够发表好的SCI文章结题,再拿到下一个,良性循环。

给很多老师指导国自然时,第一件事情是问,申请国自然的目的是什么?第二个问题是,以后还需要吗?大部分人虽然是为了升职称来申请国自然,但其中很多老师,是为了真正的去研究临床问题,想有自己的科研生涯。也就是说,不是拿了一个就结束了。这种情况下,我们在第一个课题申请的时候就需要考虑,这个课题怎么发表好的SCI结题,为下一个基金申请打下好的基础。有的时候,拿到国自然了,没有结好题,对于下一个课题申请,反而是减分。

从这个角度出发,我们来看看,这些热点中,哪些是坑,如何爬出这个坑。

今天只分析非编码RNA部分,其他方面自噬呀,外泌体呀,都还算好。

 

一、mirRNA

Mir很早就有研究,当初国内开始关注的时候,季博在国内做讲座专门讲mir的研究思路,鼓励大家去做mir的研究,因为人的基因组确定后,编码基因都已经知道。但编码基因只占基因组的1.5%左右(网络来源数据)。大部分DNA以前认为是无功能的,而mir的发现为大家开拓了非编码的领域。另外一个原因是,mir做机制,很简单,荧光素酶验证与靶基因的调控关系;功能上把与靶基因的回复实验做出来;现在做得更严谨,用RNA pulldown验证mir与靶基因mRNA直接结合。

但是,科研,是“喜新厌旧”的。高水平研究至少看两点,1、创新性。2、机制论述的严谨性。这两点也是CNS的差异所在,nature、Science偏创新性,新领域的开拓。Cell偏机制论述,机制论证的严谨性。

我们来看看mir的坑,现在很多人都说mir降温了,因为人的mir总量,基本上已经齐全了。Mir的机制论证,方法就这么几个,没有什么新意。那么mir要发好的文章,需要条件。

1、我研究的疾病中,还没有人探讨过mir是否参与。

2、我研究的细胞生理过程中,还没有人探讨过mir是否参与。

3、重要的信号通路核心分子,还没有人探讨过是否受mir调控。

创新性从高往低排。机制探讨严谨性,大家做的时候把前面提到的都做做。印象中没有新的技术方案。

另外,mir可结合靶基因3‘UTR区抑制其翻译,是经典的观点。到目前为止,也有文章在报道,mir可上调靶基因表达;mir可结合到CDS区,5’UTR区。这些也是有新意的地方。

Mir课题这个坑,您的课题有吗,如果有,赶紧考虑怎么爬出来。

 

二、lncRNA

由于mir的热潮,当lnc出来时,很多老师也上去拥抱这个热潮。但季博讲座中从不讲lnc。为什么呢,怕误导大家。临床口的申请者大部分是临床医生。对于研究中所需要的技术,不一定掌握很好。Lnc的研究有这么几个坑。

1、开始是lnc,后来发现是编码的。有老师,拿到国自然了,然后发现,研究的lnc网站上没了。没了。。。

2、我想做干扰,但没有公司能承诺筛选出有效的干扰片段。这是因为,lnc不编码,其高级结构比编码基因RNA要紧凑,设计的干扰片段很难结合到靶点区。那,没有干扰工具,咋做研究呢。我们有个老师,帮自己和科室其他医生一共拿到了5个国自然lnc面上,就遇到了这个问题。咋办,做过表达。真的可行吗。(目前5个课题,没有一个进展顺利,因为知道坑了,现在设计了后备方案来结题)

3、过表达。您的lnc有多长,做了5‘RACE了吗,3’端确定了吗。如果很长,您过表达怎么做。载体的包装容量是有限制的。

4、如果研究工具这个坑爬出来了,只有临床样品差异检测、细胞及动物功能数据,发高分文章是不够,还需要机制。Lnc的机制,目前常做的是两类,一个是找直接互作的蛋白,比如以前发CNS的,与表观调控蛋白互作。但这需要用到RNA的IP技术,非常难。某做lnc的院士,学生毕业参加工作,做新的lnc,5年都没有爬出这个坑。另一个机制是,作为mir的sponge机制,这个部分技术相对简单些。但是,这个机制,需要有lnc、mir和靶基因,不一定每个lnc都能找到明星的mir或明星的靶基因。且这一机制类型,做得人太多了。想发好文章,难。

Lnc的坑要爬出来,要么解决技术问题,把机制做严谨。要么跟mir的爬法学习,提高新颖性。

再给大家一个爬坑方法,lnc功能做出来后,机制上,不做单个分子了,直接上组学。蛋白组、磷酸化蛋白组、糖基化蛋白组。用这些组学来提供机制的分量。投5分以上。不过,这个爬坑姿势是用来发好的SCI文章的,国自然申请的话,您要是这么设计,十有八九拿不到。因为组学都是公司做,很多评审专家认为组学体现不出申请人的科研课题设计能力。虽然我们实际研究中,组学是找到目标分子很好的方法。经验告诉我们,现在国自然要求是我们已经通过组学找到目标分子了。

 

三、circRNA

环状RNA是最新出现的非编码RNA。坑是什么呢?机制研究单一。大部分环状RNA的机制部分,是作为mir的sponge来发挥作用。这个坑,与lnc机制部分的第二个坑类似,需要circRNA、mir及靶基因,技术方法上也就那几个实验。

爬坑的姿势,跟mir的类似,放到新颖性上。不过,现在很多疾病还没有circRNA的研究,可以去试试。在您做完后,可以发表5分以上文章就可以。

 

说了这么多的坑。有没有什么研究是没有坑的呢?非编码RNA,如果不考虑重复计算,3个加起来占中标数的12.7%(实际由于重复统计,还要小)。也就是说,编码基因还是主流。编码基因还是有坑的,只不过,编码基因编码了蛋白,蛋白的爬坑方法很多很多。且很多方法是高分文章喜欢的。最重要的是,蛋白,疾病发生发展相关蛋白,是候选药靶。

Anyway,国自然申请课题,设计之初就需要考虑可行性,做出来发表好的SCI,为下一个课题做准备。如果基因很不错,可以考虑看看是否可以作为诊疗的靶点。

如果您申请的时候没注意,现在中标了,正好掉进坑里了。努力从坑里面爬出来,如果真的爬不出来了,因为青年基金就3年,面上4年。那么就跟前面做lnc的老师学习,另跳一个坑,哦,不。另做一个课题,坑少的,容易爬的。发表5分以上去结题。只要是做的相同疾病,相同疾病问题,只是换了基因。只要发表了5分以上,基金委不会说您没有结好题,下一个基金的评审专家不会说您科研能力不足。

祝没中标的老师,明年中标。今年中标的老师,轻松爬出坑,发表好的SCI文章结题,顺利拿到下一个面上。

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